| 公司已经开发出一系列实用而功能强大的生物信息学综合分析软件。对于经常需要这些功能的客户,可以考虑购买软件,价格面议。另外,我们也提供软件定制服务,编写具有客户实验室特色功能的软件。对所有购买本公司软件的客户,我们均提供免费的使用培训及一年的维护 |
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| 1) 针对cDNA, mRNA及EST序列的高通量综合分析平台 |
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包含几个部分,每部分又是一个可独立运行的功能体系。基本功能: |
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| a) |
序列格式化,包括去除载体,屏蔽简单重复序列,计算核酸组成及长度,以Fasta格式输出。 |
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| b) |
比对Reference mRNA序列及Unigene序列,找出已知基因,并进行聚类分析。 |
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| c) |
对新基因序列进一步与人类染色体比对,筛选出可靠的新基因序列,排除错误序列。 |
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| d) |
新EST序列延伸,全长cDNA序列电子克隆及功能结构域分析。
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| e) |
点突变或者SNP分析 |
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| f) |
制作基因表达图谱 (PDF格式) |
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| 2) 信号通路 (Gene-gene interaction)分析平台 |
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| a) |
选择关键词,从GO数据库中寻找相关基因,比如extracellular表示为分泌蛋白 |
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| b) |
分析给定基因所属的信号通路,功能分类等 |
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| c) |
比较多组基因按功能,通路分组在统计学上的差异,从而得到各组基因的功能差异。 |
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| d) |
新信号通路的分析 |
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| 3) 基因芯片数据分析平台 |
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| a) |
对raw data进行标准化处理,并确定thredshold值(低于该值表示基因不表达,没有杂交信号) |
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| b) |
结合R/S++,SAS通过生物统计学手段筛选具有显著性差异表达的基因 |
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| c) |
进一步的芯片分析手段不一而足,可结合具体分析目标进行具体分析。已经做过的分析有:建立从array到全基因组转录图谱,基因表达图谱;聚类分析(hierarchical, SOM and K-means clustering); 结合Gene Ontology, Biocarta, KEGG数据库进行相关pathway分析等 |
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| 4) 构建全基因组genome, transcriptome基因表达图谱 |
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具体为:genome, 包含LOH,CGH水平数据; transcriptome, 包含microarray, SAGE |
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