表达谱数据分析

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表达谱数据分析：

芯片分析：

生物芯片技术是目前盛行的高通量基因表达谱检测技术，可用来对基因表达、调控以及信号通路进行快捷、有效的分析，然而其数据分析是生物学家的难题，尤其是在芯片数据标准化后进一步的数据挖掘。公司提供多种功能的芯片数据分析服务：

数据标准化

聚类分析

基于统计学的差异表达基因筛选

基于GO数据库的基因分类研究

建立全基因组表达图谱、转录图谱

结合KEGG，Biocarta等数据库的信号通路分析

也可以基于用户自行设计的研究思路

SAGE分析：

SAGE技术实际上是一种设计巧妙的全组织文库基因计数技术，由约翰霍普金斯大学首创。SAGE技术通过mRNA 3’端一个10-20bp的标签代表一个基因来完成全文库基因表达谱测定。然而，测序误差（通常为1%）会带来标签浓度的变异，尤其是低浓度标签，比如只有1个标签，会由于测序错误导致该标签代表的基因表达值为0，而产生出的错误标签可能会对不上基因，或者改变其他基因标签的实际浓度。公司提供一系列针对SAGE文库的分析，包括：

从测序结果开始分析，通过EM算法较正测序错误

基于Fisher Exact test统计学的差异表达基因筛选

基于GO数据库的基因分类研究

整合已知的相关组织高通量数据库对结果进行校正

建立全基因组表达图谱

map差异表达基因到KEGG，Biocarta等数据库的信号通路图谱

也可以基于用户自行设计的研究思路

EST 文库分析

EST文库分析系统是生物信息学分析系统中比较常见的。与翔的EST文库分析系统不但吸收了传统分析技术的精华，更在些基础上做了一些算法的优化和革新。

除了普通EST文库处，还适合多种特色EST文库分析，如抑制性消减杂交文库及全长cDNA文库分析

基于移动中位数算法的测序质量鉴定和最优片断筛选技术

合理而严格控制的新基因/新可变剪切体筛选技术

新基因（或新可变剪切体）开放阅读框的智能分析技术

所有分析结果均入MySQL数据库系统保存

等等建立全基因组表达图谱

也可以基于用户自行设计的研究思路